Сохондинский заповедник расположен на территории трёх районов Забайкальского края – Кыринского, Красночикойского и Улётовского.
Площадь заповедной территории составляет 211 тысяч гектаров,
которые окружены охранной зоной в 318 050 гектаров.
Естественным центром заповедника является гора Сохондо, высота которой
составляет более 2,5 тысячи
метров над уровнем моря.
Современная флора Сохондинского заповедника насчитывает более тысячи видов сосудистых растений. На охраняемой территории широко представлены лиственница даурская, кедр, или сосна сибирская, сосна лесная, кедровый стланик.
К реликтам сибирской флоры относятся вязы (крупноплодный и приземистый), которые образуют небольшие рощи у подножия сопок. Широко распространены рододендрон даурский и багульник болотный. На гольцах встречается рододендрон золотистый, занесённый в Красную книгу Забайкальского края. Здесь же произрастает необычная кустарниковая лиана – княжик сибирский.
Из числа редких растений на территории заповедника можно встретить три вида венериных башмачков – пятнистый, крупноцветковый и известняковый, карликовую, даурскую и жёлтую лилии, два вида ирисов – гладкий (встречается на болотах и озёрах) и тигровый – (в лесах или на участках горных степей).
Богатство фауны Сохондинского заповедника обусловлено разнообразием представленных здесь природных комплексов – от степных до альпийских. На охраняемой территории обитает 248 видов птиц, в том числе 168 гнездящихся видов и 45 оседлых, свыше 65 видов млекопитающих, восемь видов рыб, а также по три вида амфибий и рептилий.
Рыба таймень является самым редким и крупным представителем
ихтиофауны, она заходит в нижние и средние течения наиболее крупных рек
заповедника в период нереста. Другой представитель семейства лососевых – ленок – более характерный и постоянный обитатель заповедных водоёмов.
На территории заповедника проложено семь экологических маршрутов, прохождение которых занимает от трёх до семи дней. Экскурсии проводятся с мая по сентябрь. При введении режима чрезвычайной ситуации туристам запрещено посещать территорию заповедника.
Сохондинский заповедник входит в международную систему биосферных резерватов ЮНЕСКО, также является частью трансграничной особо охраняемой природной территории «Истоки Амура», в которую входят Сохондинский заповедник и Онон-Бальджинский национальный парк в Монголии.