В настоящее время основные зоны гнездования расположены в таёжных районах и на наиболее крупных лесостепных и степных озёрах Западной Сибири. В средней полосе России лебедь-кликун встречается во время миграций.
Зимует на побережьях Каспийского, Чёрного, Азовского и Средиземного морей, иногда на Балтийском море. Селится на крупных озёрах с сильно заболоченными берегами, среди массивов верховых болот или в поймах крупных рек, зарастающих непролазными ивняками.
В Саяно-Шушенском, Дарвинском, Алтайском государственных природных биосферных заповедниках, государственном природном заказнике федерального значения «Тофаларский» и некоторых других.
Птицы отличаются крупными размерами (иногда масса тела превышает десять килограммов). Самцы и самки имеют одинаковой окраски оперение – у взрослых птиц оно снежно-белое. Клюв жёлтый с чёрной вершинной половиной, причём, в отличие от малого лебедя, жёлтого больше, и раздел между жёлтым и чёрным цветами идёт по косой линии. У молодых птиц в первую осень оперение сероватое, клюв розовато-серый.
Лебеди-кликуны питаются преимущественно растительной пищей, но также и зерном, травой и сельскохозяйственными растениями (пшеницей, картофелем и морковью) – особенно зимой, когда другие источники пищи труднодоступны.
Период весенней миграции – апрель и начало мая. На местах размножения лебедь-кликун появляется в апреле. Селится отдельными парами на озёрах, расположенных среди редколесья и обширных болот.
Строя гнездо, птицы складывают в кучу стебли и листья растений на берегах, мелководьях или небольших островках. Диаметр гнезда – до двух с половиной метров. В кладке бывает четыре-семь яиц, которые самка насиживает около 40 дней. Юные птицы поднимаются на крыло в конце августа или в сентябре. В период осенней миграции (сентябрь-октябрь) молодые особи летят вместе с родителями, нередко сопровождая их даже на следующую весну. Половой зрелости лебеди-кликуны достигают в возрасте четырёх-шести лет.
Они обычно создают пары на всю жизнь и не расстаются в том числе во время миграций.
Угрозу для лебедей-кликунов представляет человеческая деятельность: охота, браконьерство, потеря и деградация среды обитания, в том числе из‑за рекультивации водно-болотных угодий, расширение зон сельского хозяйства, развитие дорог и загрязнение нефтью.