Байкальский государственный природный биосферный заповедник расположен на территории Джидинского, Селенгинского и Кабанского административных районов Республики Бурятия и занимает центральный участок горного хребта Хамар-Дабан, протянувшегося вдоль южного побережья озера Байкал.
Для северного макросклона хребта характерны острые пики, зубчатые гребни и долины с крутыми склонами, к берегу Байкала подходят мощные отроги. В этой части Хамар-Дабана отмечаются высокая влажность, мощный снеговой покров и непромерзающие почвы. При этом южный скат хребта значительно короче, отличается меньшими перепадами высот и более мягкими очертаниями.
Большая часть склонов хребта Хамар-Дабан покрыта горной тайгой, лесами занято около 70 процентов площади заповедника.
Всего на территории Байкальского заповедника и его охранной зоны произрастает 1169 видов высших сосудистых растений, включая 30 реликтовых и 15 эндемичных видов растений. 14 видов занесены в Красную книгу Российской Федерации, 49 – в Красную книгу Республики Бурятия. Кроме того, в заповеднике числится 298 видов мхов, 775 видов лишайников и 425 видов грибов.
На природоохранной территории обитает 381 вид позвоночных животных, в том числе 52 вида млекопитающих, 308 видов птиц, два вида рептилий, два вида амфибий и 17 видов рыб, часть из которых также занесена в региональную и федеральную Красные книги.
Из млекопитающих в заповеднике распространены бурый медведь, волк, лисица, росомаха, соболь, горностай, заяц-беляк, белка, бурундук, благородный олень, лось, сибирская косуля, кабарга, кабан, также встречается дикий северный олень – лесной подвид алтае-саянской популяции.
В Байкальском заповеднике постоянно обитают 55 видов птиц, в том числе рябчик, тундряная куропатка, обыкновенный глухарь, малый пёстрый, большой пёстрый и белоспинный дятлы, обыкновенный поползень, ворон, оляпка, буроголовая гаичка, московка, большая синица, кедровка и кукша. Из хищных птиц встречаются ястреб-тетеревятник, мохноногий и воробьиный сычи, длиннохвостая и бородатая неясыти, ястребиная сова.
Основная часть гнездящихся в заповеднике птиц – перелётные, более трети видов встречаются на природоохранной территории в период миграций.
Байкальский заповедник обладает развитой туристической инфраструктурой. В центральной усадьбе в посёлке Танхой расположены Музей природы и этнографический городок, на территории исторического порта посёлка находится визит-центр «Байкал заповедный» с современными интерактивными экспозициями.
Для туристов разработаны сезонные эколого-познавательные туры, проводятся пешеходные экскурсии по тропам с деревянным настилом и прогулки-экскурсии на камусных лыжах и на снегоходах в зимнее время. Подготовлены образовательные программы по орнитологии, ботанике и геологии.
В 1986 году Байкальский заповедник был включён в Международную сеть биосферных резерватов, в 1996 году – в состав объекта «Озеро Байкал» Всемирного природного наследия ЮНЕСКО. С 2018 года заповедник является членом Международного альянса охраняемых территорий (IAPA).