Национальный парк «Ладожские шхеры» расположен на территориях Сортавальского, Лахденпохского и Питкярантского районов Республики Карелия, а также занимает около 53 тысяч гектаров акватории Ладожского озера. Поскольку шхеры – это архипелаг, состоящий из небольших скалистых островов, разделённых проливами, нацпарк преимущественно включает в себя береговую полосу Ладоги с многочисленными заливами и островами.
В границах заповедной территории отмечено около 750 видов высших сосудистых растений. В отличие от других районов Карелии здесь сочетаются различные группы северных, южных, сибирских и атлантических видов. В лесах, занимающих большую часть заповедной территории, преобладает сосна, также встречается ель, берёза бородавчатая и пушистая, осина.
Фауна национального парка представлена 121 видом гнездящихся птиц, из которых 31 занесён в Красные книги России и Республики Карелия. Здесь обитает множество видов лесных пернатых, на внутренних озёрах и в заливах встречаются водные и околоводные птицы.
В «Ладожских шхерах» зафиксировано 49 видов млекопитающих, из которых 19 относятся к охраняемым. Особого внимания заслуживает животное-эндемик – ладожская кольчатая нерпа, занесённая в международную и российскую Красные книги. Территория нацпарка является одним из ключевых мест размножения и нагула нерпы.
Для гостей национального парка создано около десяти разнообразных экологических маршрутов.