Национальный парк «Сайлюгемский» был создан в Республике Алтай на границе России и Монголии. Он стал первым нацпарком в регионе.
Его территория состоит из трёх участков: «Сайлюгем», «Аргут» и «Уландрык».
Местная флора своеобразна и неоднородна по составу. Так, на хребте Сайлюгем господствующим типом растительности являются степи и опустыненные степи. Большую площадь занимают высокогорные тундры.
На заповедной территории произрастают растения, занесённые в Красную книгу Республики Алтай: астрагалы (аксайский, аргутский, коротколистный, морщинистый, Политова, роскошный, чуйский) и остролодочники (Ладыгина, Мартьянова, нижнеальпийский, пузырчатоплодный, пушистопузырчатый, Сапожникова).
Нацпарк «Сайлюгемский» – место обитания крупнейшей трансграничной группировки алтайского горного барана аргали (около 2600 особей) на границе России и Монголии. Здесь также расположены основные места его ягнения.
Кроме того, в среднем и нижнем течении реки Аргут обитает крупнейшая группировка снежного барса, насчитывающая 20 особей (или четверть от всей популяции в стране).
Национальный парк также является домом для одной из самых многочисленных в Алтае-Саянском экорегионе группировок сибирского горного козла (козерога). На хребте Сайлюгем обитает гнездовая группировка сокола-балобана, численность которого в регионе находится под угрозой из‑за интенсивного браконьерского отлова.
Среди представителей животного мира нацпарка особенно выделяется сайлюгемская популяция бурого медведя, которая занесена в Красную книгу Республики Алтай. Особи данного вида очень светлые, желтовато-белые со светлыми когтями, за что их называют белокоготными.
На участке «Сайлюгем» постоянно обитает манул – небольшая дикая кошка, которая не встречается на других особо охраняемых природных территориях в Республике Алтай. С 2016 года в нацпарке ведётся мониторинг и изучение манула: создана первая учётная площадка, в проекте участвуют учёные со всего мира.
Есть также сведения о заходах из Монголии на территорию региона дзерена – антилопы, на сегодняшний день полностью исчезнувшей в России.
Всего в нацпарке зарегистрировано 50 видов млекопитающих.
На двух участках нацпарка встречается до 149 видов птиц. 20 из них занесены в Красную книгу Российской Федерации и Республики Алтай: мохноногий курганник, орлан-белохвост, степной орёл, беркут, бородач, чёрный гриф, белоголовый сип, балобан, сапсан, степная пустельга, алтайский улар, жемчужный вьюрок и ряд других.
Для посетителей доступны конные, пешие, автомобильные маршруты продолжительностью от двух до 12 дней, а также эколого-просветительские экскурсии как в самом нацпарке, так и на прилегающих территориях.