Научное издание состоит из семи разделов: покрытосеменные растения, голосеменные растения, папоротникообразные, мохообразные, водоросли, лишайники и грибы.
По словам Министра природных ресурсов и экологии Российской Федерации Александра Козлова, выходу Красной книги, посвящённой растениям и грибам, предшествовала большая научная работа, так как список редких видов не обновлялся почти 20 лет. Всего том содержит информацию о 741 виде редких растений и грибов.
Часть из 167 объектов растительного мира, занесённых в Красную книгу, произрастает на территории Крыма и Донбасса. В новом томе также отмечены три вида, за незаконный сбор и умышленное уничтожение которых предусмотрена уголовная ответственность: женьшень настоящий, родиола розовая и рядовка мацутакэ.
В обновлённом издании сохранены шесть категорий статуса редкости объектов, которые использовались в прошлых версиях. Дополнительно введены статусы оценки угрозы и исчезновения, а также три категории природоохранного приоритета.
В создании тома приняли участие 200 авторов из научно-исследовательских институтов и вузов, сотрудники особо охраняемых природных территорий и ботанических садов из всех регионов страны.